鉴定出超过 5,000 种新的 RNA 病毒。
一项新的研究表明,在世界海洋中发现了 5,000 多种新病毒。
该研究的研究人员分析了来自全球的数以万计的水样,寻找 RNA 病毒或使用 RNA 作为其遗传物质的病毒。例如,新型冠状病毒是一种 RNA 病毒。作者说,与使用 DNA 作为遗传物质的 DNA 病毒相比,这些病毒的研究不足。
新发现的病毒的多样性是如此之大,以至于研究人员建议将 RNA 病毒分类所需的分类群数量从现有的 5 个门增加到 10 个门。 (门是生物学中的一个广义分类,仅次于“王国”。)
“这里有很多新的多样性——在整个海洋中发现了一个完整的 [新] 门,即 Taraviricota,这表明它们在生态上很重要,”研究的主要作者、俄亥俄州立大学微生物学教授马修·沙利文 (Matthew Sullivan) ,在一份声明中说(在新标签中打开)。
据沙利文说,对 RNA 病毒的研究通常集中在那些引起疾病的病毒上。 (一些著名的 RNA 病毒包括流感、埃博拉病毒和导致 COVID-19 的冠状病毒。)但沙利文说,这些只是地球上 RNA 病毒的“一小部分”。
沙利文在声明中说:“我们想在一个非常大的范围内系统地研究它们,并探索一个没有人深入研究过的环境。”
对于周四(4 月 7 日)发表在《科学》杂志上的这项研究(在新标签中打开),研究人员分析了从全球 5 个海洋的 121 个地点采集的 35,000 个水样。研究人员是 Tara Oceans Consortium 的一部分,这是一个研究气候变化对海洋影响的全球项目。
研究人员说,他们检查了从称为浮游生物的小型水生生物中提取的基因序列,浮游生物是 RNA 病毒的常见宿主。他们通过寻找一种名为 RdRp 的古老基因来定位属于 RNA 病毒的序列,该基因存在于所有 RNA 病毒中,但在其他病毒和细胞中不存在。他们鉴定了超过 44,000 个带有该基因的序列。
但是RdRp基因已有数十亿年的历史,并且已经进化了很多次。由于基因的进化可以追溯到很久以前,研究人员很难确定序列之间的进化关系。因此,研究人员使用机器学习来帮助组织它们。
总体而言,他们确定了大约 5,500 种新的 RNA 病毒物种,它们属于五个现有的门,以及五个新提出的门,研究人员将其命名为 Taraviricota、Pomiviricota、Paraxenoviricota、Wamoviricota 和 Arctiviricota。
研究人员在 The Conversation 中写道,Taraviricota 门中的病毒种类在温带和热带水域特别丰富,而 Arctiviricota 门中的病毒在北冰洋中则很丰富。
作者说,了解 RdRp 基因如何随着时间的推移而分化,可以更好地了解地球上早期生命是如何进化的。
“RdRp 应该是最古老的基因之一——它在需要 DNA 之前就已经存在,”该研究的共同第一作者、俄亥俄州立大学微生物学研究科学家 Ahmed Zayed 在声明中说。 “所以我们不仅要追踪病毒的起源,还要追踪生命的起源。”