7月22日 – 中国卫健委副主任曾益新周四表示，中国不接受世界卫生组织（WHO）提出的新冠溯源第二阶段计划，指计划透露出对常识的不尊重和“对科学的傲慢态度”。
“当我一开始看到世卫的第二阶段溯源计划的时候，我是十分吃惊的。因为在这个计划里面将‘中国违反实验室规程造成病毒泄漏’这个假设作为研究重点之一”，曾益新在国新办举行的新闻发布会上说。
此前WHO提出，应就新冠病毒溯源在中国展开第二阶段调查，调查对象应包括武汉所有的实验室和市场，并呼吁中方有关部门保持透明度。
曾益新表示，新冠病毒溯源是个科学问题，中国政府支持科学地开展病毒溯源。但是反对将溯源工作政治化，第二阶段病毒溯源应该在第一阶段病毒溯源的基础上来延伸，对第一阶段病毒溯源时已经开展过的，尤其是已经有了明确结论的，就不应该再重复开展。
“应该在成员国充分广泛磋商的基础上，推动在全球多国多地范围内开展早期病例搜索、分子流行病学、动物（中间）宿主等方面的溯源工作。”曾益新称。
至于处于舆论漩涡的武汉病毒研究所，该所研究员兼中科院武汉国家生物安全实验室主任袁志明在新闻会上表示，世卫专家组亲自到武汉病毒所进行实地考察，得出病毒由实验室泄漏极不可能的结论，对他们的结论，应该要尊重。
“所谓第二阶段溯源计划，在一些方面可以说是既不尊重常识，也违背科学。我们是不可能接受这样一个溯源计划的”，他说。
他指出，2019年12月30日之前，武汉病毒研究所没有接触、保藏和研究过新冠病毒；武汉病毒研究所从来没有设计、制造和泄漏新冠病毒；目前为止武汉病毒研究所的职工和研究生，保持新冠病毒的“零感染”。
曾益新提到，中国专家组在7月4日曾经向世卫提出了第二阶段溯源工作的中国建议，真正地将新冠病毒溯源作为一个科学问题，摆脱政治干扰，积极稳妥推动在全球多国多地范围内持续开展溯源，要加强各国溯源科研的合作交流，要尽快找到最有可能的病毒源头，尽最大努力预防类似的疫情再次发生。
对于新冠病毒溯源，中国外交部发言人此前表示，奉劝有关方面停止在溯源问题上搞政治操弄，停止利用溯源问题甩锅推责，停止蓄意破坏国际溯源研究合作。